在巨人横行的世界，调查兵团一直肩负着人类复兴的希望。然而，在一次壁外调查中，士兵们意外发现了墙内隐藏的古老实验室。实验室的日志揭示了巨人化的秘密：一种名为‘始祖药剂’的物质可以暂时赋予人类巨人之力，但代价是失去记忆和人性。团长埃尔文决定封印这一发现，避免兵团内部因权力斗争而分裂。但一名年轻士兵在药剂的影响下，意外获得了与巨人沟通的能力，揭示了巨人背后真正的主宰者——一个意图消灭人类的上古意识。人类与巨人的战争，由此揭开更深层的真相。