在第二季中，航班不再是普通的夜航，而是载着特殊乘客的“幽灵航班”。机长林峰发现，每趟航班都有至少一名乘客在深夜航班后神秘失踪。他联合空乘小鹿，暗中调查真相。原来，航班上潜伏着一群名为“夜行者”的杀手，利用高空无信号环境实施绑架。林峰必须在万米高空中，与时间赛跑，救出被绑架的乘客，并揭露背后的巨大阴谋。这一季剧情更加紧张，空中动作场面火爆，悬疑感层层递进，让观众在云端感受心跳加速的刺激。